作物科学所-刘允军导师介绍
刘允军
副研究员
硕士生导师
男
作物科学所
作物遗传育种
玉米转基因与基因编辑,玉米籽粒发育分子机制解析
liuyunjun@caas.cn
中国农业科学院作物科学研究所 副研究员。 2004在中国农业大学获得遗传学专业博士学位，2005-2007年在瑞典Lund 大学从事博士后工作，2007年进入中国农业科学院作物科学研究所工作至今。主要研究方向为玉米转基因与基因编辑、玉米籽粒发育分子机制解析。主持国家自然科学基金、生物育种课题、973任务等课题。以第一或通讯作者在Nucleic Acids Research, Plant Physiology, Journal Experimental Botany, Plant Cell Physiology等主流SCI期刊发表论文40余篇，获得第一发明人授权专利8项。
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科研项目
1. 国家自然科学基金“ZmAlba6提高农杆菌遗传转化效率的分子机理解析”，起止时间2024.1-2027.12，经费50万元，主持人。
2. 生物育种课题“玉米高产耐密植等优异种质创制”，起止时间2022.12-2025.12，经费150万元，主持人。
3. 横向课题“玉米转基因技术开发研究”，起止时间2022.2-2026.1，经费300万元，主持人
4. 国家自然科学基金“SMK11表观遗传调控玉米籽粒发育的分子机制”，起止时间2019.1-2022.12，经费60万元，主持人。
5. 转基因重大专项任务“玉米规模化转基因技术体系构建”，起止时间2011.1-2020.12，经费615万元，主持人。
6. 中国农科院所级统筹科研业务费“基于新型不育系的玉米杂交育种技术的建立”（S2018QY07），起止时间2018.1-2020.12，经费90万元，主持人。
7. 科技部973任务“玉米品质性状的全基因组遗传解析”，起止时间2014.1-2018.12，经费67万元，主持人。
8. 教育部留学人员基金“玉米锌指蛋白基因ZmSAP13的功能及作用机制研究”，起止时间2010.1-2010.10， 经费4万元，主持人。
9. 转基因重大专项子课题“抗病虫、抗除草剂转基因玉米新品种培育”，起止时间2011.1-2020.12，经费1000万元，参加，主要执行人。
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研究成果
1. Chen QQ, Guo YM, Zhang J, Zheng NN, Wang J, Liu Y, Lu JW, Zhen SH, Du XM, Li L, Fu JJ, Wang GY, Gu RL*, Wang JH*, Liu YJ* (2023) RNA polymerase common subunit ZmRPABC5b is transcriptionally activated by Opaque2 and essential for endosperm development in maize. Nucleic Acids Research, 51:7832-7850.
2. Ren ZJ, Fan KJ, Zhen SH, Zhang J, Liu Y, Fu JJ, Qi QL, Wei QH, Du Y, Tatar W, Zhang XF, Wang GY, Rasmusson AG, Wang JH*, Liu YJ* (2023) Tetratricopeptide-containing SMALL KERNEL 11 is essential for the assembly of cytochrome c oxidase in maize mitochondria. Plant Physiology, 192:170-187.
3. Chen RR, Wei QH, Liu Y, Li JK, Du XM, Chen Y, Wang JH*, Liu YJ* (2023) The pentatricopeptide repeat protein EMP601 functions in maize seed development by affecting RNA editing of mitochondrial transcript ccmC. Crop Journal, 11:1368-1379.
4. Fan KJ, Fu QH, Wei QH, Jia SN, Zhao AQ, Wang TT, Cao J, Liu Y, Ren ZJ*, Liu YJ* (2022) ZmnMAT1, a nuclear-encoded type I maturase, is required for the splicing of mitochondrial Nad1 intron 1 and Nad4 intron 2 . Frontiers in Plant Science, 13:1033869.
5. Fan KJ, Ren ZJ, Zhang XF, Liu Y, Fu JJ, Qi CL, Tatar W, Rasmusson AG*, Wang GY*, Liu YJ* (2021) The pentatricopeptide repeat protein EMP603 is required for the splicing of mitochondrial Nad1 intron 2 and seed development in maize. Journal of Experimental Botany, 72: 6933–6948.
6. Xu QL, Yang L, Kang D, Ren ZJ, Liu YJ* (2021) Maize MS2 encodes an ATP-binding cassette transporter that is essential for anther development. The Crop Journal,9:1301–1308.
7. Zhang J, Zhang X, Chen R, Yang L, Fan K, Liu Y, Wang G, Ren Z*, Liu YJ* (2020) Generation of transgene-free semidwarf maize plants by gene editing of gibberellin-oxidase20-3 using CRISPR/Cas9. Frontiers in Plant Science 11: 1048.
8. Du XM, Fang T, Liu Y, Wang M, Zang MS, Huang LY, Zhen SH, Zhang J, Shi ZC, Wang GY, Fu JJ*, Liu YJ* (2020) Global profiling of N6-methyladenosine methylation in maize callus induction. Plant Genome e20018
9. Du XM, Fang T, Liu Y, Huang LY, Wang XL, Zhang J, Cui YB, Zang MS, Wang GY, Fu JJ*, Liu YJ* (2020) Global profiling of alternative splicing in callus induction of immature maize embryo. In Vitro Cell Dev Bioy –Plant，56:159–168
10. Ren Z, Fan K, Fang T, Zhang J, Yang L, Wang J, Wang G*, Liu YJ* (2019) Maize Empty pericarp602 encodes a P-type PPR protein that is essential for seed development. Plant Cell Physiology 60(8): 1734-1746.
11. Du X, Fang T, Liu Y, Huang L, Zang M, Wang G, Liu YJ*, Fu J* (2019) Transcriptome profiling predicts new genes to promote maize callus formation and transformation. Frontiers in Plant Science 10: 1633.
12. Chen R, Xu Q, Liu Y, Zhang J, Ren D, Wang G, Liu YJ* (2018) Generation of transgene-free maize male sterile lines using the CRISPR/Cas9 system. Frontiers in Plant Science 9: 1180.
13. Liu Y, Zhang Z, Fu J, Wang G, Wang J, Liu YJ * (2017) Transcriptome analysis of maize immature embryos reveals the roles of cysteine in improving Agrobacterium infection efficiency. Frontiers in Plant Science 8: 1778.
14. Kang D, Wang CY, Xu QL, Wang GY, Liu YJ* (2017) Characterization of maize male sterile2 mutant by phenotypic and RNA sequencing analyses. Plant Breeding. 136:319-330.
15. Cao Z, Zhang W, Ning X, Wang B*, Liu YJ*, Li QX* (2017) Development of monoclonal antibodies recognizing linear epitope: Illustration by three Bacillus thuringiensis crystal proteins of genetically modified cotton, maize, and tobacco. Journal of Agricultural and Food Chemistry 65(46): 10115-10122.
16. Liu YJ, Zhang YW, Liu Y, Lu W, Wang GY (2015) Metabolic effects of glyphosate on transgenic maize expressing a G2-EPSPS gene from Pseudomonas fluorescens. Journal of Plant Biochemistry Biotechnology，24:233-241.
17. Liu YJ#, Cao GY#, Chen RR, Zhang SX, Ren Y, Lu W, Wang JH, Wang GY (2015) Transgenic tobacco simultaneously overexpressing glyphosate acetyltransferase and 5-enolpyruv-ylshikimate-3-phosphate synthase are more resistant to glyphosate than those containing one gene. Transgenic Research. 24:753-763.
18. Ren ZJ, Cao GY, Zhang YW, Liu Y, Liu YJ* (2015) Overexpression of a modified AM79 aroA gene in transgenic maize confers high tolerance to glyphosate. Journal of Integrative Agriculture, 14:414-422
19. Ren ZJ, Liu Y, Kang D, Fan KJ, Wang CY, Wang GY, Liu YJ (2015) Two alternative splicing variants of maize HKT1;1 confer salt tolerance in transgenic tobacco plants Plant Cell Tissue Organ Culture, 123:569-578.
20. Yuan Y, Qi LJ, Yang J, Wu C, Liu YJ*, Huang LQ* (2015) A Scutellaria baicalensis R2R3-MYB gene, SbMYB8, regulates flavonoid biosynthesis and improves drought stress tolerance in transgenic tobacco. Plant Cell Tissue Organ Culture , 120:961-972.
21. Zhang YW, Liu Y, Zhang J, Wang GY, Wang JH, Liu YJ* (2015) Assessment of transgene copy number and zygosity of transgenic maize overexpressing Cry1Ie gene with SYBR® Green qRT-PCR. In Vitro Cellular and Developmental Biology–Plant, 51:125 -134
22.Zhang YW#, Liu YJ#, Ren Y, Liu Y, Liang GM, Song FP, Bai SX, Wang JH, Wang GY (2013) Overexpression of a novel Cry1Ie gene confers resistance to Cry1Ac-resistant cotton bollworm in transgenic lines of maize. Plant Cell Tissue Organ Culture, 115: 151-158.
23.Zhang SX, Lian Y, Liu Y, Wang XQ，Liu YJ*, Wang GY* (2013) Characterization of a maize wip1 promoter in transgenic plants. International Journal of Molecular Sciences, 14:23872-23892.
24.Yuan Y, Wu C, Liu YJ*, Yang J, Huang LQ* (2013) The Scutellaria baicalensis R2R3 MYB transcription factors modulates flavonoid biosynthesis by regulating GA metabolism in transgenic tobacco plants. PLoS ONE，8：e77275.
25.Liu YJ, Yuan Y, Liu YY, Liu Y, Fu JJ, Zheng J, Wang GY (2012) Gene families of maize glutathione–ascorbate redox cycle respond differently to abiotic stresses Journal of Plant Physiology, 169:183-192.
26. Cao GY#, Liu YJ#, Zhang SX, Yang XW, Chen RR, Zhang YW, Lu W, Wang JH, Lin M, Wang GY (2012) A novel 5-nolpyruvylshikimate -3-phosphate synthase shows high glyphosate tolerance in Escherichia coli and tobacco plants. PLoS ONE, 7：e38718.
27. Yuan Y#, Liu YJ#, Wu C, Chen S, Wang ZY, Yang ZC, Qin SS, Huang LQ (2012) Water deficit affected flavonoid accumulation by regulating hormone metabolism in Scutellaria baicalensis Georgi roots. PLoS ONE，7:e42946.
28. Liu YJ, Nunes-Nesi A, Wallstrom SV, Lager I, Michalecka AM, Norberg FE, Widell S, Fredlund KM, Fernie AR, Rasmusson AG (2009) A redox-mediated modulation of stem bolting in transgenic Nicotiana sylvestris differentially expressing the external mitochondrial NADPH dehydrogenase. Plant Physiology, 150:1248-1259.
授权专利
1. 刘允军，刘艳，王国英，任珍静，陈岩，施建琴. 一种转基因玉米VB15外源插入片段的旁侧序列及其应用 （专利号 ZL202311302047.9）
2. 刘允军,王国英,刘艳. 一种抗虫转基因玉米AM63插入位点的外源插入片段的旁侧序列及其应用 （专利号 ZL202110401503.X）
3. 刘允军，刘艳，王国英. 玉米BBM1基因在提高植物遗传转化效率中的应用 （专利号 201910411582.6）
4. 刘允军,王国英,刘艳.一种农杆菌侵染玉米幼胚的方法(专利号201310022133.4)
5.刘允军,王国英,刘艳.一种通过弱光培养体系快速获得转基因植物的方法 (专利号201710090814.2)
6.刘允军,王国英,张煜文,刘艳. 融合杀虫蛋白Cry1Am、其编码基因及应用(专利号201510175515.X)
7.刘允军,张煜文,王国英,何康来.一种杀虫蛋白及其编码基因与应用( 专利号201410591794.3)
8.刘允军,任珍静,王国英. 一种玉米耐盐基因及其应用 (专利号201410838479.6)
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学校介绍
中国农业科学院研究生院成立于1979年，1981年经国务院批准开始实施硕士、博士学历学位教育，是我国国家级科研机构举办研究生教育的先行院所之一。作为支撑我院研究生教育的中国农业科学院成立于1957年，是农业农村部直属的综合性国家农业科研机构，是全国综合性农业科学研究的最高学术机构，是农业及农业科学技术战略咨询机构，是三农领域国家战略科技力量，担负着全国农业重大基础与应用基础研究、应用研究和高新技术技术研究的任务，致力于解决我国农业及农村经济发展中公益性、基础性、全局性、战略性、前瞻性的重大科学与技术问题。在推动农业科技创新、服务经济社会发展、培养高层次人才、促进国际交流与合作等方面发挥着重要作用。“十三五”期间，共获得国家科学技术奖36项，占全国农业领域获奖总数的26%。其中科技进步一等奖1项，自然科学二等奖2项，技术发明二等奖6项，科技进步二等奖27项；获得省部级奖励229项；发表论文近30000篇，其中SCI论文近15000篇、《NATURE》《SCIENCE》《CELL》等国际顶级学术期刊论文29篇；出版专著近1500部，通过国审品种等近1200个，获得植物新品种权397项，新兽药证书55个等。科研成果与科研实力处于行业领先地位。
中国农科院研究生教育依托中国农业科学院的国家级科研平台基地、先进科研设施设备、重大科研攻关项目、稳定的科研经费保障、前沿交叉学科集群、一流的导师队伍、广泛的国际合作机制、丰富的图书文献等各种重要资源，形成了38个研究所共同参与、“院所结合、两段式培养”这一特色鲜明的科研机构举办研究生教育的创新模式，将中国农业科学院的科研资源优势转化为学科建设、人才培养、特色办学优势，为研究生完成课程教学、开展学术研究、参与课题实践、培养创新能力提供了农业科研国家队特有的广阔舞台。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称“基因组所”），创建于2014年，是农业农村部，中国农科院和深圳市在科技体制改革的背景下，整合农业基因组学研究力量在深圳成立的新型研究所。
成立以来，基因组所深入贯彻落实习近平总书记“四个面向、两个一流”指示精神，开展科研自主权改革试点工作，被列为中国农科院现代院所改革的“试验田”，建设了由中国农科院与深圳市主管领导任共同理事长的理事会；组建了近800人的研究队伍；形成了以组学技术为核心、辐射农业、食品和生态方向的学科体系，获批“岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心”“农业农村部农业基因数据分析重点实验室”等创新载体；在包括 Science、Nature、Cell 等顶级期刊在内的杂志上发表SCI论文400多篇，以基因组设计育种育成国审、省审新品种30余个，农业基因组学等研究领域占据世界前沿。 2019年、2020年连续两年自然指数排名全国农业类科研院所第一名，多项成果入选“‘十三五’农业科技十大标志性成果”“中国生命科学十大进展”“中国农业科学十大进展”。先后获得“何梁何利基金”奖、“周光召基础科学奖”“深圳经济特区建立40周年创新创业和先进模范人物”“深圳市市长奖”等奖励。基因组所联合深圳市相关部门提出了“深圳国际食品谷”，规划已得到市政府印发，将构建农业食品产学研协作生态，做出科技推动农业食品产业转型升级的先行示范。
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按照国家相关规定，我院全日制与非全日制硕士研究生学费标准均为：8000元/人/年。凡我院各研究所录取的推免生均免收第一年学费，优秀推免生免收基本学制内全部学费。
我院全日制非定向硕士研究生奖助学金体系由奖学金和助学金两部分组成。奖学金包括国家奖学金、学业奖学金（100%覆盖）、研究生院单项奖学金和企业奖学金。助学金包括国家助学金、研究生院助学金、导师助研津贴、“三助”津贴和特困生补助，具体奖助学金政策可登陆中国农业科学院研究生院网站查询。
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