基因组所-周永锋导师介绍
周永锋
研究员
硕，博士生导师
男
基因组所
农艺与种业
,★生物信息学
,资源利用与植物保护
葡萄群体基因组学与全基因组设计育种,作物驯化群体遗传学,保护基因组学
zhouyongfeng@caas.cn
硕士招生专业
1
农艺与种业
2022
1
专业学位硕士
园艺科学
周永锋，中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员，博士生导师。中国农业科学院青年英才，深圳市海外高层次人才。2007年本科毕业于兰州大学，2010年获得兰州大学生态学博士学位。2010年10至2020年12月，先后在欧洲和美国学习交流。2012年与2014年分别获得奥卢大学(Universityof Oulu) 群体遗传学专业硕士和博士学位，师从芬兰科学院院士Outi Savolainen教授，2014-2020年先后在奥卢大学与美国加州大学从事博士后研究，师从美国艺术与科学院院士BrandonGaut。2020年底回国以后，全职加入中国农科院农业基因组研究所。成立了葡萄群体基因组学与全基因组设计育种研究团队，开展了葡萄、水稻等作物驯化的群体遗传学研究，揭示了作物的驯化成本，研究了重要农艺性状相关的适应性变异、有害变异与结构变异及其基因组育种意义。先后获得奥卢大学优秀毕业研究生、加州大学优秀青年研究员奖、共发表SCI论文20多篇，其中以第一或通讯作者在Nature Plants（3篇）、PNAS、 Molecular Biology and Evolution等杂志发表SCI论文12篇，研究成果被Nature Plants, Science Daily等多家科研媒体报道。Nature Plants, Nature Communications, MBE, Plos Genetics, GenomeBiology, Genetics等期刊常年审稿人，欧盟科学研究基金（ERC）评委，SCI一区期刊Horticulture Research、Horticulturae等期刊副主编或编委成员。课题组主页请见：https://yongfengzhou.wordpress.com/
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科研项目
1. 农科院基因组所启动经费，葡萄群体基因组学与全基因组设计育种，120万元，2021-01 至2022-01，主持
2. 欧盟委员会（European Commission），重大项目，FP7 289841_ProCoGen，2012-01 至2016-01，280 万欧元，主要完成人。
3. 美国自然科学基金（NSF），重点项目，1542703，2015-06至2019-07，296,666美元， 已完成，主要完成人。
4. 美国自然科学基金（NSF），重大项目，1741627，2018-04-2022-04，2,073,480美元 ，本人工作已 完成，主要完成人。
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研究成果
| Zhong HX, Liu ZJ, Zhang FC, Zhou XM, Sun XX, Liu WW, Xiao H, Wang N, Pan MQ, Wu XY, Zhou YF (2021) Metabolomic and transcriptomic analyses reveal the effects of grafting on anthocyanin synthesis in grapevine bioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2021.10.09.463741 |
| Morales-Cruz A, Aguirre-Liguori J, Zhou Y, Minio A, Riaz S, Walker AM, Cantu D, Gaut BS. (2021) Extensive introgression among North American wild grapes (Vitis) fuels biotic and abiotic adaptation. Genome Biology. 254: https://doi.org/10.1186/s13059-021-02467-z |
| Kou Y, Liao Y, Toivainen T, Lv Y, Tian X, Emerson JJ, Gaut BS#, Zhou Y# (2020) Evolutionary Genomics of Structural Variation in Asian Rice (Oryza sativa) Domestication. Mol. Biol. Evol. 37:3507–3524. |
| Zhou Y#, Gaut BS# (2020) Large chromosomal variants drive adaptation in sunflowers. Nature Plants 6:734–735. |
| Massonnet M, Cochetel N, Minio A, Vondras AM, Lin J, Muyle A, Zhou YF, et al. (2020) The genetic basis of sex determination in grapes. Nat Commun. 11: 2902. |
| Zhou YF, Minio A, Solares E, Lyu Y, Cantu D#, Gaut BS# (2019) Population genetics of structural variation in grapevine domestication. Nature Plants, 5, 965–979. |
| Zhou YF, Muyle A, Gaut BS (2019) Evolutionary Genomics and the Domestication of Grapes. The Grape Genome, Dario Cantu and M. Andrew Walker (Eds). |
| Zhou YF, Minio A, Solares E, Lyu Y, Cantu D#, Gaut BS# (2019) Structural variants, clonal propagation, and genome evolution in grapevine (Vitis vinifera). bioRxiv, doi:10.1101/508119. |
| Lv YD, Hu FQ, Zhou YF, Wu FL, Gaut BS (2019) Maize transposable elements contribute to long non-coding RNAs that are regulatory hubs for abiotic stress response. BMC Genomics 20 (1), 864 |
| Vondras AM, Minio A, Blanco-Ulate B, Figueroa-Balderas R, Penn MA, Zhou YF, Seymour D, Zhou Y, Liang D, Espinoza LK, Anderson MM, Walker AM, Gaut BS, Cantu D (2019) The genomic diversification of clonally propagated grapevine. bioRxiv, doi:10.1101/585869 |
| Hu FQ, Zhou YF, Wu FL, Lv YD, Gaut BS (2019) Maize transposable elements contribute to long non-coding RNAs that are regulatory hubs for abiotic stress response. bioRxiv: doi: https://doi.org/10.1101/801704. |
| Fan B, Zhou Y, Ma Q, Yu Q, Zhao C, Sun K (2018) The Bet-Hedging Strategies for Seedling Emergence of Calligonum mongolicum to Adapt to the Extreme Desert Environments in Northwestern China. Front. Plant Sci. 9: 1167. |
| Gaut BS, Seymour D, Liu QP, Zhou YF# (2018) Demography and its effects on genomic variation in crop domestication. Nature Plants 4: 512–520. |
| Tian XM, Wang QY, Zhou YF# (2018) Euphorbia section Hainanensis (Euphorbiaceae), a new section endemic to the Hainan Island of China from biogeographical, karyological, and phenotypical evidence. Front. Plant Sci. 9: 660. |
| Zhou YF, Massonnet M, Sanjak J, Cantu D, Gaut BS (2017) Evolutionary genomics of grape (Vitis vinifera ssp. vinifera) domestication. PNAS 114: 11715-11720. |
| Liu QP, Zhou YF, Morrell P, Gaut B (2017) Deleterious variants in Asian rice and the potential cost of domestication. Molecular Biology and Evolution 34: 908-924. |
| Zhou YF, Duvaux L, Ren G, Zhang LR, Savolainen O, Liu J (2017) Importance of incomplete lineage sorting and introgression in the origin of shared genetic variation between two closely related pines with overlapping distributions. Heredity 118: 211-220. |
| Zhou YF, Zhang LR, Liu JQ, Wu GL, Savolainen O (2014) Climatic adaptation and ecological divergence between two closely related pines species in Southeast China. Molecular Ecology 23: 3504–3522. |
| Zhou YF (2014) Demographic history and climatic adaptation in ecological divergence between two closely related parapatric pine species. Acta Universitatis Ouluensis. A, Scientiae rerum naturalium, ISSN: 0355-3191. Thesis. |
| Ren GP, Abbott RJ, Zhou YF, Zhang LR, Peng YL, Liu JQ (2012) Genetic divergence, range expansion and possible homoploid hybrid speciation among pine species in northeast China. Heredity 108: 552-562. |
| Jiang ZY, Peng YL, Hu XX, Zhou YF, Liu JQ (2011) Cytoplasmic DNA variation in and genetic delimitation of Abies nephrolepis and Abies holophylla in northeastern China. Canadian Journal of Forest Research, 41:1555-1561. |
| Zhang LR, Peng YL, Ren GP, Zhou YF, Li ZH, Liu JQ (2011) Population genetic diversity and species divergence of Pinus massoniana and P. hwangshanensis at two nucleotide loci. Chinese Journal of Plant Ecology 35: 531-538 (In Chinese with English abstract). |
| Li Y, Stocks M, Hemmilä S, Källman T, Zhu HT, Zhou YF, Chen J, Liu JQ, Lascoux M (2010) Demographic histories of four spruce (Picea) species of the Qinghai-Tibetan Plateau and neighboring areas inferred from multiple nuclear loci. Molecular Biology and Evolution 27: 1001-1014. |
| Zhou YF, Abbott RJ, Jiang ZY, Du, FK, Milne RI, Liu JQ (2010) Gene flow and species delimitation: a case study of two pine species with overlapping distributions in southeast China. Evolution 64: 2342-2352. |
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学校介绍
中国农业科学院研究生院成立于1979年，1981年经国务院批准开始实施硕士、博士学历学位教育，是我国国家级科研机构举办研究生教育的先行院所之一。作为支撑我院研究生教育的中国农业科学院成立于1957年，是农业农村部直属的综合性国家农业科研机构，是全国综合性农业科学研究的最高学术机构，是农业及农业科学技术战略咨询机构，是三农领域国家战略科技力量，担负着全国农业重大基础与应用基础研究、应用研究和高新技术技术研究的任务，致力于解决我国农业及农村经济发展中公益性、基础性、全局性、战略性、前瞻性的重大科学与技术问题。在推动农业科技创新、服务经济社会发展、培养高层次人才、促进国际交流与合作等方面发挥着重要作用。“十三五”期间，共获得国家科学技术奖36项，占全国农业领域获奖总数的26%。其中科技进步一等奖1项，自然科学二等奖2项，技术发明二等奖6项，科技进步二等奖27项；获得省部级奖励229项；发表论文近30000篇，其中SCI论文近15000篇、《NATURE》《SCIENCE》《CELL》等国际顶级学术期刊论文29篇；出版专著近1500部，通过国审品种等近1200个，获得植物新品种权397项，新兽药证书55个等。科研成果与科研实力处于行业领先地位。
中国农科院研究生教育依托中国农业科学院的国家级科研平台基地、先进科研设施设备、重大科研攻关项目、稳定的科研经费保障、前沿交叉学科集群、一流的导师队伍、广泛的国际合作机制、丰富的图书文献等各种重要资源，形成了38个研究所共同参与、“院所结合、两段式培养”这一特色鲜明的科研机构举办研究生教育的创新模式，将中国农业科学院的科研资源优势转化为学科建设、人才培养、特色办学优势，为研究生完成课程教学、开展学术研究、参与课题实践、培养创新能力提供了农业科研国家队特有的广阔舞台。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称“基因组所”），创建于2014年，是农业农村部，中国农科院和深圳市在科技体制改革的背景下，整合农业基因组学研究力量在深圳成立的新型研究所。
成立以来，基因组所深入贯彻落实习近平总书记“四个面向、两个一流”指示精神，开展科研自主权改革试点工作，被列为中国农科院现代院所改革的“试验田”，建设了由中国农科院与深圳市主管领导任共同理事长的理事会；组建了近800人的研究队伍；形成了以组学技术为核心、辐射农业、食品和生态方向的学科体系，获批“岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心”“农业农村部农业基因数据分析重点实验室”等创新载体；在包括 Science、Nature、Cell 等顶级期刊在内的杂志上发表SCI论文400多篇，以基因组设计育种育成国审、省审新品种30余个，农业基因组学等研究领域占据世界前沿。 2019年、2020年连续两年自然指数排名全国农业类科研院所第一名，多项成果入选“‘十三五’农业科技十大标志性成果”“中国生命科学十大进展”“中国农业科学十大进展”。先后获得“何梁何利基金”奖、“周光召基础科学奖”“深圳经济特区建立40周年创新创业和先进模范人物”“深圳市市长奖”等奖励。基因组所联合深圳市相关部门提出了“深圳国际食品谷”，规划已得到市政府印发，将构建农业食品产学研协作生态，做出科技推动农业食品产业转型升级的先行示范。
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按照国家相关规定，我院全日制与非全日制硕士研究生学费标准均为：8000元/人/年。凡我院各研究所录取的推免生均免收第一年学费，优秀推免生免收基本学制内全部学费。
我院全日制非定向硕士研究生奖助学金体系由奖学金和助学金两部分组成。奖学金包括国家奖学金、学业奖学金（100%覆盖）、研究生院单项奖学金和企业奖学金。助学金包括国家助学金、研究生院助学金、导师助研津贴、“三助”津贴和特困生补助，具体奖助学金政策可登陆中国农业科学院研究生院网站查询。
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