根据团队的发展目标和研究任务，我们在动物遗传育种与繁殖、细胞生物学遗传学、生物信息学和转基因技术等方面通过各种渠道引进了急需的人才。目前团队共有19名成员，其中研究员1名，副研究员1名，博士后3名，助理研究员7名，在读博士生4名，在读硕士生3名。

在岗位设置方面，我们根据科研和学科需要，从德国哈勒-维滕贝格大学引进一名生物学博士进行三维空间构象技术研究和管理工作；从农科院畜牧兽医研究所引进一名具有遗传育种与繁殖经验的博士进行细胞及基因编辑平台的搭建；从农科院引进一名具有三维基因组学技术和单细胞多组学技术研发经验的博士进行eHi-C体系的建立；另外为了顺利推进基因组和功能基因组的数据分析工作，我们分别从兰州大学和华南农业大学引进了硕士生到本团队进行数据分析和技术研发工作；为了实验的顺利进行，我们引进包括浙江大学、广西大学等国内多所高校的优秀硕士生及本科生。目前团队成员除了在学科方向和专业结构方面优势互补外，我们还注重人才在年龄结构上的合理分布，形成了20至45岁的年龄梯度，有利于发挥科研体系和管理方面的“传帮带”作用。

为了加强团队成员的业务水平，提高大家的理论和实践水平，及时了解国内外同行的发展，我们同国内外不同实验室建立了合作关系，包括中国科学院，中国农业科学院，上海交通大学，美国国立卫生研究院（NIH），麻省理工（MIT），斯坦福（Stanford University），劳伦斯伯克利国家实验室（LBL），加州大学旧金山分校（UCSF），意大利米兰比可卡大学（University of Milano-Bicocca）和法国波尔大学（University of Bordeaux）等不同研究机构的研究人员。通过多种形式的学术活动培养大家的科研意识和团队合作精神。

在团队日常科研生活工作中，张玉波研究员为营造和谐、积极、向上的团队文化，打造卓越团队、构建良性互动交流机制，团队每周定期组会，讨论国内外最新研究进展，指导团队成员并给出规划与建议；每年进行一次团建活动；每年拍摄一次实验室纪念视频。团队整体气氛和谐，实验室科研气氛浓厚，产出多篇高水平文章，申请多项专利。

       近五年来，本团队创新工程获支持885.42万元，申请并主持竞争性项目共17项。其中国家科技计划项目4项，共计232万元；省部级科研项目经费7项，共计130万元；市级科研项目经费5项，共计1007.5万元；累计获得竞争性科研经费共计1369.5万元。获得横向经费76万元，团队总科研经费累计超1400万元。

· 小鼠早期发育过程中三维转录调控网络研究

构建动态三维转录调控网络，整合组学数据，阐明关键转录因子或调控元件的生物学效应，揭示动物早期发育过程中重大科学问题。

· 三维基因组学相关生物信息学新算法研发及应用

以在线展示、解析三维基因组学数据为导向，进行生物信息学新算法的研发，及现存算法的优化、标准化及程式化研究。

· 三维基因组学技术研发

以实践精准生物学为导向，研发可靠、高效的三维基因组学技术，对基因或调控元件及远距离互作的生物学效应进行研究，为在精准生物学提供技术支持。

研究论文

[1] Yubo Zhang, Chee Hong Wong, Ramon Birnbaum, Guoliang Li, Rebecca Favaro, Chew Yee Nyan, Eunice Tai, Joanne Lim Hui Ping, Huay Mei Poh, Fabianus Hendriyan Mulawadi, Silvia Nicolis, Nadav Ahituv, Yijun Ruan and Chia-Lin Wei. Dynamic chromatin connectivity maps reveal lineage specific regulation. Nature. 2013, 504, 306-310.

[2] Siyuan Kong, Qing Li, Gaolin Zhang, Qiujia Li, Qitong Huang, Lei Huang, Hui Zhang, Yinghua Huang, Yanling Peng, Baoming Qin, Yubo Zhang, Exonuclease combinations reduce noises in 3D genomics technologies. Nucleic Acids Research, 2020.gkaa106, https://doi.org/10.1093/nar/gkaa106

[3]黄其通，李清，张玉波. 染色质构象与基因功能. 遗传. 2020, 42 (1): 1-17.   DOI: 10.16288/j.yczz.19-257

[4]Kong, S. & Zhang, Y. Deciphering Hi-C: from 3D genome to function. Cell Biol Toxicol. 2019 Feb;35(1):15-32.  (通讯作者)

[5]Peng YL, Zhang YB. Enhancer and super-enhancer: Positive regulators in gene transcription. Animal Model Exp Med. 2018; 1:169-179. (通讯作者)

[6]张玉波. 三维基因组学与精准生物学[J]. 中国生物化学与分子生物学报, 2018, 34(4): 351-363. (通讯作者)

[7]Kamada R, Yang W, Zhang Y, Patel MC, Yang Y, Ouda R, Dey A, Wakabayashi Y, Sakaguchi K, Fujita T, Tamura T, Zhu J, Ozato K., Interferon stimulation creates chromatin marks and establishes transcriptional memory. Proc Natl Acad Sci., 2018, 115(39):E9162-E9171 doi: 10.1073/pnas.1720930115. (共同一作)

[8]Xiusheng Zhu, Lei Huang, Qing Li, Yubo Zhang. Start from Scratch: Precisely Identify Massive Active Enhancers by Sequencing. bioRxiv 604686; doi: https://doi.org/10.1101/604686. (通讯作者)

[9]Lei Huang, Qing Li, Qitong Huang, Siyuan Kong, Xiusheng Zhu, Yanling Peng, Yubo Zhang. Enhancer-promoter association determines Sox2 transcription regulation in mouse pluripotent cells. bioRxiv 590745; doi: https://doi.org/10.1101/590745. (通讯作者)

[10] Lusy Handoko, Han Xu, Guoliang Li, Chew Yee Ngan, Elaine Chew, Marie Schnapp, Charlie Wah Heng Lee, Chaopeng Ye, Joanne Lim Hui Ping, Fabianus Mulawadi, Eleanor Wong, Jianpeng Sheng, Yubo Zhang, Thompson Poh, Chee Seng Chan, Galih Kunarso, Atif Shahab, Guillaume Bourque, Valere Cacheux-Rataboul, Wing-Kin Sung, Yijun Ruan & Chia-Lin Wei. CTCF-mediated functional chromatin interactome in pluripotent cells. Nature Genetics. 2011, 43, 630-638.

[11]McReynolds LJ, Yang Y, Yuen Wong H, Tang J, Zhang Y, Mulé MP, Daub J, Palmer C, Foruraghi L, Liu Q, Zhu J, Wang W, West RR, Yohe ME, Hsu AP, Hickstein DD, Townsley DM, Holland SM, Calvo KR, Hourigan CS. MDS-associated mutations in germline GATA2 mutated patients with hematologic manifestations. Leuk Res. 2019 Jan;76:70-75.

[12]McReynolds LJ, Zhang Y, Yang Y, Tang J, Mulé M, Hsu AP, Townsley DM, West RR, Zhu J, Hickstein DD, Holland SM, Calvo KR, Hourigan CS. Rapid progression to AML in a patient with germline GATA2 mutation and acquired NARS Q61K. Leukemia Research Reports. Leuk Res Rep. 2019 Jun 10; 12:100176. doi: 10.1016/j.lrr.2019.100176. eCollection 2019.

[13]Kong S, Ruan J, Zhang K, Hu B, Cheng Y, Zhang Y, Yang S, Li K. Kill two birds with one stone: making multi-transgenic pre-diabetes mouse models through insulin resistance and pancreatic apoptosis pathogenesis. Peer J. 2018 Apr 17;6:e4542. doi: 10.7717/peerj.4542.

[14]Ting Ni, Wenjing Yang, Miao Han, Yubo Zhang, Ting Shen1, Hongbo Nie, Zhihui Zhou, Yalei Dai, Yanqin Yang, Poching Liu, Kairong Cui, Zhouhao Zeng, Yi Tian, Bin Zhou, Gang Wei, Keji Zhao, Weiqun Peng, Jun Zhu. Global intron retention mediated gene regulation during CD4+ T cell activation. Nucleic Acids Research. 2016, 19;44(14):6817-29.

[15]Kong S, Li L, Zhu W, Xin L, Ruan J, Zhang Y, Yang S, Li K. Genetic characteristics of polycistronic system‑mediated randomly‑inserted multi‑transgenes in miniature pigs and mice. Mol Med Rep. 2018, 17(1):37-50.

[16]Tang Z, Wu Y, Yang Y, Yang YT, Wang Z, Yuan J, Yang Y, Hua C, Fan X, Niu G, Zhang Y, Lu ZJ, Li K. Comprehensive analysis of long non-coding RNAs highlights their spatio-temporal expression patterns and evolutional conservation in Sus scrofa. Sci Rep. 2017, 7:43166

[17] Sakurai T, Sakurai A, Chen Y, Vaisman BL, Amar MJ, Pryor M, Thacker SG, Zhang X, Wang X, Zhang Y, Zhu J, Yang ZH, Freeman LA, Remaley AT. Dietary α-cyclodextrin reduces atherosclerosis and modifies gut flora in apolipoprotein E-deficient mice. Mol Nutr Food Res. 2017, doi: 10.1002/mnfr.201600804.

发明专利

· 张玉波，李东卫，黄其通，黄雷，李清；一种基于超顺磁性纳米颗粒的DNA提取吸附液试剂盒以及DNA提取方法，2020，申请号为：202010046781.3

· 张玉波，李秋佳；一种高通量测序调取未知RNA全长序列的方法，2020，申请号为：202010398919.6

· 张玉波，朱秀生，黄雷，李清；一种活性增强子筛选载体及其构建方法，2019，专利申请号为：201910529227.8

· 张玉波，朱秀生，黄雷，李清；一种基于随机序列利用载体筛选活性增强子的方法，2019，专利申请号为：20190529253.0

· 张玉波，付亚娟，徐波，王帅；一种精准获得全基因组范围内结构变异的方法，2018，专利申请号为：201811546406.4

· 张玉波，孔思远，张高林，范磊，黄其通，李清，黄雷，彭艳玲；一种消除三维基因组学技术噪音的方法及应用[P]. 2018，广东：申请号CN201810589919.7

· 张玉波；孔思远，张高林，黄其通，范磊，李清，黄雷，彭艳玲；利用外切酶组合消除三维基因组学技术噪音的方法及应用[P]. 2018，广东：申请号CN201810589904.0

· 张玉波，孔思远，黄其通，李琳，黄雷，白立景，彭艳玲；一种基于少量细胞全基因组染色质高分辨率构象技术eHi-C 2.0，2017，专利申请号为：201710773996.3

· 张玉波，孔思远，黄其通，黄雷，王秋雁，白立景，张高林，钟学优；一种高效的全基因组染色质构象技术eHi-C，2016，授权公告号为：CN106566828B