主持国家重点研发计划项目、国家自然科学基金面上项目、湖北省自然科学基金面上项目、中国农科院中加合作项目、油料所杰出青年人才培育项目等8项，主持总经费超过1000万元。参加完成了国家自然科学基金重点项目、国家科技支撑计划、国家973计划等多项重大项目资助的课题研究。

以第一作者或通讯作者（含共同）在Nature Communications、Genome Biology、Plant Biotechnology Journal、Plant Communications, Plant Journal、Journal of Experimental Botany、BMC Genomics、Frontiers in Genetics、Plant Science等杂志。获授权软件著作权2项，参与国家发明专利11项。主要成果为：1）申请人先后负责完成甘蓝型油菜春性、冬性、半冬性、根用、油用、菜用等代表性品种的基因组精细图，同时对数千份油菜种质资源开展高深度重测序，通过解析和整合千份油菜资源基因组变异，构建了染色体水平的线性的油菜泛基因组；2）解析了甘蓝型油菜亚基因组表达分化及表观遗传调控机制。通过RNA和表观遗传水平的比较分析，阐述了油菜A和C亚基因组表达分化，明确了小RNA介导DNA甲基化在亚基因组互作中的表观调控作用。