油料所-张园园导师介绍
张园园
副研究员
硕士生导师
男
油料所
生物化学与分子生物学
,作物遗传育种
基因组设计育种,生物大数据整合解析复杂性状形成机制,群体多组学数据关联分析,多倍体基因组进化规律解析
zhangyy@caas.cn
招生信息
1
生物化学与分子生物学
2026
1
学术型硕士
基因组学与蛋白质组学,农艺与种业
张园园，中国农业科学院油料作物研究所特聘研究员。研究生毕业于华中农业大学和美国加州大学戴维斯分校，面向国家油料生物育种重大需求，系统开展了甘蓝型油菜基因组设计育种的理论与技术创新研究，工作重点解析多倍体作物基因组进化规律、作物性状调控机制、特异优良种质创制，构建了多倍体作物“理论创新－技术突破－种质创制”协同改良的基因组设计育种体系。主持国家自然科学基金青年项目和面上项目、国家重点研发计划课题、洪山实验室重点项目课题等7项。发现了多倍体亚基因组不对称进化规律，为生物多样性保护和利用与新育种方法研发提供了理论基础；研发出多组学联合高通量解析基因表达变异和性状变异的方法，并创制了全球首例兼具叶片高硫苷（高抗病）且种子低硫苷（高品质）的油菜新种质，突破了植物单一代谢物介导的抗病与品质性状难以协同改良的技术瓶颈；攻克了植物跨物种杂交基因组渐渗效率低的育种难题，为性状遗传提供了关键技术。以第一作者或通讯作者在Nature Genetics、Plant Biotechnology Journal、Journal of Advanced Research、Plant Physiology、Plant, Cell & Environment等杂志发表SCI文章20余篇，授权发明专利10余项，入选农业农村部“神农英才”计划、中国农业科学院“杰出青年英才”计划和“武汉英才”计划，获湖北省农业农村厅科普类二等奖1项。担任Horticulture Research、Frontiers in Plant Science、Frontiers in Bioinformatics和油料作物学报（中、英文版）等期刊编委。
实验室网站：https://www.ocri-genomics.net/
个人网页：https://www.ocri-genomics.net/author/yuanyuan-zhang-ph.d./
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科研项目
1）中国农业科学院农科英才“杰出青年英才”计划项目，2026.01-2030.12，600万，主持
2）油菜基因组设计育种的理论与技术及其应用，中央级科研院所基本科研业务费专项，2026.01-2028.12，150万，主持
3）甘蓝型油菜叶片高硫苷种子低硫苷的调控机制解析及种质创制，国家自然科学基金面上项目，32370681，50万元，2024-2027，主持；
4）油菜籽营养品质形成机理与全产业链质量控制，湖北洪山实验室重大项目课题资助，2022hszd002，440万元，2022-2026，课题主持；
5）芸臺属近缘种 DNA 渐渗入 A 基因组的热点区研究，华北作物改良与调控国家重点实验室 2021 年度开放研究课题，NCCIR2021KF-6，10万元，2021-2024，主持；
6）基于代谢组的关联分析发掘油菜菌核病抗性相关基因资源，自家自然科学基金青年基金，31801730，23万元，2019-2021，主持；
7）基于代谢组的关联分析发掘油菜菌核病抗性相关基因资源，中国博士后科学基金特别资助，2018T110166，15万元，2018-2019，主持；
8）基于代谢组的关联分析解析油菜抗菌核病的分子机理，中国博士后科学基金面上资助，2016M601188，5万元，2016-2017，主持；
9）小麦等作物规模化基因鉴定与基因组育种技术平台建设，国家重点研发计划课题，2016YFD0101001，36万元，2016-2020，子课题主持。
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研究成果
1）Yuanyuan Zhang, ZhiquanYang, Yizhou He, Dongxu Liu, Yueying Liu, Congyuan Liang, Meili Xie, YupengJia, Qinglin Ke, Yongming Zhou, Xiaohui Cheng, Junyan Huang, Lijiang Liu, YangXiang, Harsh Raman, Daniel J. Kliebenstein, Shengyi Liu, and Qing-Yong Yang."Structural Variation Reshapes Population Gene Expression and TraitVariation in 2,105 Brassica napus Accessions." Nature Genetics 56, no. 11 (2024): 2538-50. https://dx.doi.org/10.1038/s41588-024-01957-7.（2023IF=31.8，第一作者；全面解析基因组结构变异调控基因表达和表型变异的分子机制）
2）Aixia Gu, Xiaomin Li, Zengfeng Wang, Yanhua Wang, Shuxin Xuan, WeiMa, Yalei Zhao, Xueping Chen, Shuangxia Luo, Yuanming Liu, Shengyi Liu, Yuanyuan Zhang*, Jianjun Zhao, and ShuxingShen. "A Triploid-mediated Geneticsystem of Generating Extremely High Genomic Segment Introgression From Brassica oleracea to B. rapa."Plant Biotechnology Journal, no. 1 (2025) https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14564（2023 IF=11.2，通讯作者；创建了由异源三倍体介导的白菜–甘蓝高频渐渗平台，实现了跨物种的大规模渐渗育种）
3) Yizhou He, Zhiquan Yang, Minqiang Tang, Qing-Yong Yang, Yuanyuan Zhang*, and Shengyi Liu."Enhancing Canola Breeding by Editing a Glucosinolate Transporter GeneLacking Natural Variation." Plant Physiology 188, no. 4 (2022): 1848-51. https://dx.doi.org/10.1093/plphys/kiac021.（2022IF=8.005，通讯作者；开发了多拷贝基因功能鉴定的新思路/方法，创制了油菜育种上可直接利用的种子低硫苷、营养组织高硫苷的种质资源）
4） Xueyan Wang, Xuan Tian, Xiong Zhang, Yizhou He, Qinglin Ke, Li Yu, Fei Ma, Xuefang Wang, Shengyi Liu, Yuanyuan Zhang*, Liangxiao Zhang, Peiwu Li. “Functional divergence of BnaWRKY7 homologs drives phytosterol variations in polyploid Brassica napus.” Journal of Advanced Research (2025) https://doi.org/10.1016/j.jare.2025.10.050 (IF=13.0，通讯作者。解析了油菜籽甾醇含量的积累模型和调控机制，揭示了多倍体作物中重复基因功能分化的新策略，为同时提高作物产量与品质提供了新的策略)
5）Raman, Harsh, Rosy Raman, RamethaaPirathiban, Brett McVittie, Niharika Sharma, Shengyi Liu, Yu Qiu, Anyu Zhu,Andrzej Kilian, Brian Cullis, Graham D. Farquhar, Hilary Stuart-Williams,Rosemary White, David Tabah, Andrew Easton, and Yuanyuan Zhang*. "Multienvironment QTL AnalysisDelineates a Major Locus Associated with Homoeologous Exchanges for Water-UseEfficiency and Seed Yield in Canola." Plant, Cell & Environment 45, no. 7 (2022): 2019-36. https://dx.doi.org/https://doi.org/10.1111/pce.14337.（2022IF=7.947，通讯作者；鉴定并解析了由非同源重组交换(HE)引起的一个调控油菜水分利用率和产量相关性状的QTL位点）
6) Xueyan Wang, Min Liu, Ruinan Yang, Xiaobo Cui, Jie Liu, Yu Zhang,Yizhou He, Li Yu, Fei Ma, Xiong Zhang, YuanyuanZhang*, Shengyi Liu, Peiwu Li, and Liangxiao Zhang. "Metabolome and Transcriptome Analysis Reveal the Effect of Methyl Jasmonate on Phytosterol Biosynthesis in Brassica napus." Food Frontiers 5, no. 5 (2024): 2319-32. https://dx.doi.org/https://doi.org/10.1002/fft2.420.（2023IF=9.9，通讯作者；阐述了茉莉酸甲酯对油菜甾醇合成的调控机制）
7) Yizhou He, Yan Li, Zetao Bai, Meili Xie, Rong Zuo, Jie Liu, JingXia, Xiaohui Cheng, Yueying Liu, Chaobo Tong, Yuanyuan Zhang*, and Shengyi Liu."Genome-Wide Identification and Functional Analysis of Cupin_1Domain-Containing Members Involved in the Responses to Sclerotinia Sclerotiorum and Abiotic Stress in Brassica napus." Frontiers in Plant Science 13:983786 (2022). https://dx.doi.org/10.3389/fpls.2022.983786. （2022IF=6.627，通讯作者；解析了BnCDPs基因对油菜菌核病和非生物胁迫的调控机制）
8) MMU Helal, Rafaqat Ali Gill, Minqiang Tang, Li Yang, Ming Hu,Lingli Yang, Meili Xie, Chuanji Zhao, Xiaohui Cheng, Yuanyuan Zhang*, XiongZhang, and Shengyi Liu. "Snp- and Haplotype-Based Gwas of Flowering-RelatedTraits in Brassica napus." Plants 10, no. 11 (2021): 2475. https://www.mdpi.com/2223-7747/10/11/2475. （通讯作者；利用Haplotype-GWAS相较于SNP-GWAS的优势剖析了油菜开花调控的遗传结构）
9) Minqiang Tang, Juanling Li, Xu Hu, Lu Sun, MMU Helal, Jianguo Chen,and Yuanyuan Zhang*. "Asymmetric Divergence in Transmitted Snps of DNAReplication/Transcription and Their Impact on Gene Expression in Polyploid Brassica napus." Frontiers in genetics 12:756172, no.2182 (2021). https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2021.756172. （通讯作者；解析了多倍体油菜中DNA复制和RNA转录突变的亚基因组不对称性）
10）Yuanyuan Zhang, Baohua Li, Dongxin Huai, Yongming Zhou, and Daniel J. Kliebenstein."The Conserved Transcription Factors, Myb115 and Myb118, ControlExpression of the Newly Evolved Benzoyloxy Glucosinolate Pathway in Arabidopsis Thaliana." Frontiers in Plant Science 6 (2015): 343. https://dx.doi.org/10.3389/fpls.2015.00343. （第一作者；报道了调控硫苷合成代谢的两个MYB转录因子）
11）Yuanyuan Zhang, Dongxin Huai, Qingyong Yang, Yang Cheng, Ming Ma, Daniel J. Kliebenstein,and Yongming Zhou. "Overexpression of Three Glucosinolate Biosynthesis Genes in Brassica napus Identifies Enhanced Resistanceto Sclerotinia sclerotiorum and Botrytis cinerea." PloS One 10, no. 10 (2015): e0140491. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0140491. （第一作者；通过调控硫苷合成基因增强对油菜菌核病的抗病性）
12）Baohua Li, Yuanyuan Zhang, SA. Mohammadi, Dongxin Huai, Yongming Zhou, and Daniel J.Kliebenstein. "An Integrative Genetic Study of Rice Metabolism, Growth and Stochastic Variation Reveals Potential C/N Partitioning Loci." Scientific Reports 6 (2016):30143. https://dx.doi.org/10.1038/srep30143. （并列第一作者；群体代谢组水平阐述了植物碳/氮分配的调控机制）
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学校介绍
中国农业科学院研究生院成立于1979年，1981年经国务院批准开始实施硕士、博士学历学位教育，是我国国家级科研机构举办研究生教育的先行院所之一。作为支撑我院研究生教育的中国农业科学院成立于1957年，是农业农村部直属的综合性国家农业科研机构，是全国综合性农业科学研究的最高学术机构，是农业及农业科学技术战略咨询机构，是三农领域国家战略科技力量，担负着全国农业重大基础与应用基础研究、应用研究和高新技术技术研究的任务，致力于解决我国农业及农村经济发展中公益性、基础性、全局性、战略性、前瞻性的重大科学与技术问题。在推动农业科技创新、服务经济社会发展、培养高层次人才、促进国际交流与合作等方面发挥着重要作用。“十三五”期间，共获得国家科学技术奖36项，占全国农业领域获奖总数的26%。其中科技进步一等奖1项，自然科学二等奖2项，技术发明二等奖6项，科技进步二等奖27项；获得省部级奖励229项；发表论文近30000篇，其中SCI论文近15000篇、《NATURE》《SCIENCE》《CELL》等国际顶级学术期刊论文29篇；出版专著近1500部，通过国审品种等近1200个，获得植物新品种权397项，新兽药证书55个等。科研成果与科研实力处于行业领先地位。
中国农科院研究生教育依托中国农业科学院的国家级科研平台基地、先进科研设施设备、重大科研攻关项目、稳定的科研经费保障、前沿交叉学科集群、一流的导师队伍、广泛的国际合作机制、丰富的图书文献等各种重要资源，形成了38个研究所共同参与、“院所结合、两段式培养”这一特色鲜明的科研机构举办研究生教育的创新模式，将中国农业科学院的科研资源优势转化为学科建设、人才培养、特色办学优势，为研究生完成课程教学、开展学术研究、参与课题实践、培养创新能力提供了农业科研国家队特有的广阔舞台。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称“基因组所”），创建于2014年，是农业农村部，中国农科院和深圳市在科技体制改革的背景下，整合农业基因组学研究力量在深圳成立的新型研究所。
成立以来，基因组所深入贯彻落实习近平总书记“四个面向、两个一流”指示精神，开展科研自主权改革试点工作，被列为中国农科院现代院所改革的“试验田”，建设了由中国农科院与深圳市主管领导任共同理事长的理事会；组建了近800人的研究队伍；形成了以组学技术为核心、辐射农业、食品和生态方向的学科体系，获批“岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心”“农业农村部农业基因数据分析重点实验室”等创新载体；在包括 Science、Nature、Cell 等顶级期刊在内的杂志上发表SCI论文400多篇，以基因组设计育种育成国审、省审新品种30余个，农业基因组学等研究领域占据世界前沿。 2019年、2020年连续两年自然指数排名全国农业类科研院所第一名，多项成果入选“‘十三五’农业科技十大标志性成果”“中国生命科学十大进展”“中国农业科学十大进展”。先后获得“何梁何利基金”奖、“周光召基础科学奖”“深圳经济特区建立40周年创新创业和先进模范人物”“深圳市市长奖”等奖励。基因组所联合深圳市相关部门提出了“深圳国际食品谷”，规划已得到市政府印发，将构建农业食品产学研协作生态，做出科技推动农业食品产业转型升级的先行示范。
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按照国家相关规定，我院全日制与非全日制硕士研究生学费标准均为：10000元/人/年。凡我院各研究所录取的推免生均免收第一年学费，优秀推免生免收基本学制内全部学费。
我院全日制非定向硕士研究生奖助学金体系由奖学金和助学金两部分组成。奖学金包括国家奖学金、学业奖学金（100%覆盖）、研究生院单项奖学金和企业奖学金。助学金包括国家助学金、研究生院助学金、导师助研津贴、“三助”津贴和特困生补助，具体奖助学金政策可登陆中国农业科学院研究生院网站查询。
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