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长期从事棉花黄萎病（大丽轮枝菌）致病机理及综合防控的研究，利用寄主诱导的基因沉默技术，挖掘了一批与病原菌致病及生长发育相关的关键基因；通过基因同源替换以及转基因等技术，系统研究了靶标基因的生物学功能，并获得了具有明显抗性的RNAi转基因阳性材料（烟草、马铃薯和棉花），为病原菌的防控工作提供了良好的实验数据和实验材料。
迄今为止，先后主持国家自然科学基金（青年基金）1项和博士后基金1项，作为研究骨干多次参与国家自然科学基金、转基因重大专项和农业部公益性行业科研专项等课题研究，以第一作者发表SCI论文10篇，累计影响因子为30；授权国家发明专利8项及实用新型专利1项，其中第一完成人4项。受邀参加“一带一路”首届中-巴棉花生物技术与创新国际研讨会并作会议报告。
[1]. 大丽轮枝菌ADP-ATP载体蛋白及其在能量代谢途径的调控机制，国家自然科学基金-青年基金，31701861，2018-2020，24万元（主持人）；
[2]. 大丽轮枝菌致病性关键基因的挖掘以及致病机理的研究，博后基金，2015M571174，2015-2016，5万元（主持人）；
[3]. 作物黄萎病生防菌的挖掘及应用研究，河北省土传病害绿色防控技术创新中心开放课题，2021-2022，3万元（主持人）；
[4]. 棉花黄萎病菌中硫氨素转运蛋白及其在硫氨素代谢途径的调控机制，国家自然科学基金-面上基金，31772244，2018-2021，60万元（研究骨干）；
[5]. 新型防治作物黄萎病生防制剂的研制，公益性行业（农业）科研专项，201503109，2015-2019，190万元（研究骨干）。
[1]. Su, X.#; Lu, G.#; Li, X.; Rehman, L.; Liu, W.; Sun, G.; Guo, H.; Wang, G.*; Cheng, H*. (2020). Host-induced gene silencing of an adenylate kinase gene involved in fungal energy metabolism improves plant resistance to Verticillium dahliae. Biomolecules 10, 127-142.
[2]. Li, X.#, Su, X.#, Lu, G., Sun, G., Zhang, Z., Guo, H., Guo, N., Cheng, H.*. (2019). VdOGDH is involved in energy metabolism and required for virulence of Verticillium dahliae. Current Genetics 66, 345-359.
[3]. Su, X.#, Lu, G.#, Guo, H., Zhang, K., Li, X., Cheng, H*. (2018). The dynamic transcriptome and metabolomics profiling in Verticillium dahliae inoculated Arabidopsis thaliana. Scientific Reports 8: 15404-15414.
[4]. Su, X.#, Lu, G.#, Rehman, L., Li, X., Sun, L., Guo, H., Cheng, H*. (2018). mCherry-labeled Verticillium dahliae could be utilized to investigate its pathogenicity process in Nicotiana benthamiana. Genes 9: 508-520.
[5]. Su, X., Rehman, L., Guo, H., Li, X., and Cheng, H*. (2018). The oligosaccharyl transferase subunit STT3 mediates fungal development and is required for virulence in Verticillium dahliae. Current Genetics 64: 235-246.
[6]. Rehman, L.#, Su, X.#, Li, X., Qi, X., Guo, H., and Cheng, H*. (2018). FreB is involved in the ferric metabolism and multiple pathogenicity-related traits of Verticillium dahliae. Current Genetics 64: 645-659.
[7]. Su, X., Rehman, L., Guo, H., Li, X., Zhang, R.*, and Cheng, H*. (2017). AAC as a potential target gene to control Verticillium dahliae. Genes 8:25-41.
[8]. Rehman, L.#, Su, X.#, Guo, H., Qi, X., and Cheng, H*. (2016) Protoplast transformation as a potential platform for exploring gene function in Verticillium dahliae. BMC Biotechnology 16: 57-65.
[9]. 大丽轮枝菌 ADP-ATP 载体蛋白病程关键靶基因及其干扰载体和应用, 国家发明专利, 授权号: ZL201510557932.0, 第一完成人.
[10]. 大丽轮枝菌VdEG抗病原菌靶基因片段及其干扰载体和应用, 国家发明专利, 授权号: ZL202010534157.8, 第一完成人.
[11]. 大丽轮枝菌腺苷酸激酶靶基因片段及其干扰载体和应用, 国家发明专利, 授权号: ZL201510791947.3, 第一完成人.
[12]. 大丽轮枝菌寡糖基转移酶靶基因片段及其干扰载体和应用, 国家发明专利, 授权号: ZL201510792533.2, 第一完成人.
[13]. 大丽轮枝菌硫氨素转运蛋白病程关键靶基因及其干扰载体和应用. 国家发明专利, 授权号: ZL201510353744.6, 第四完成人.
[14]. 大丽轮枝菌硫胺素转运蛋白基因的敲除突变体菌株及应用. 国家发明专利, 授权号：ZL201510394685.7, 第四完成人.
[15]. 大丽轮枝菌磷脂酶靶基因片段及其干扰载体和应用, 国家发明专利, 授权号: ZL201510794698.3, 第三完成人.
[16]. 与抗真菌危害有关的磷脂酶靶基因片段及其在提高植物抗病性中的应用, 国家发明专利, 授权号: ZL201510792509.9, 第三完成人.
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