猪呼吸道传染病团队围绕猪呼吸道病毒细菌性感染这一困扰我国养猪业发展的瓶颈问题，开展基础理论、应用基础和应用技术研究，弄清造成病毒细菌性感染的机制，研发新的防控技术。主要以猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪流感病毒、猪乙型脑炎病毒等病毒和副猪嗜血杆菌、猪链球菌等细菌为研究对象，研究天然免疫应答机制，鉴定重要调控分子，阐明病毒和细菌单独感染和混合感染的免疫机制和致病机制。主持“973”、国家科技支撑、公益性行业项目、国家自然科学基金等国家、省部级科研课题多项，团队发表学术论文100多篇，其中SCI论文40多篇，申报专利多项。

     近年来，先后主持国家自然科学基金、“973”计划子课题、上海市自然基金面上项目，上海市农业领域重点项目等国家、省部级科研课题12项，总经费456万元。

（一）主持项目（12项，总经费456万元）

1.        国家自然科学基金委员会，应急项目，31941012，非洲猪瘟病毒流行特征、毒株的遗传演化、溯源与早诊检技术，2020-01至2022-12，30万元，子任务负责人；

2.        上海市科学技术委员会，农业领域项目，20392002400，便携式恒温基因扩增仪及其配套的非洲猪瘟现场快速检测试剂的研制，2020-06至2023-10，70万；

3.        上海市农业委员会，科技兴农科技术创新项目，2021-02-08-00-12-F00770，养殖场专用蚊蝇驱避剂的研究与应用示范，2021-5至2024-4，99.68万；

4.        上海市科学技术委员会，自然基金面上项目，19ZR1469000，p53调控ZDHHC1抗乙型脑炎病毒机制的研究，2019-07至2022-06，20万；

5.        中国农业科学院基本科研业务费专项院级统筹项目，Y2020PT40，重组乙型脑炎病毒技术研究，2020 -01至2021 -12，83万元；

6.        中国农业科学院基本科研业务费专项院级统筹项目，Y2020YJ15，抗非洲猪瘟病毒新型基因工程疫苗创制，2021-1至2021-12，40万元，子任务负责人；

7.        横向课题：上海罗克环控节能科技股份有限公司，消毒屋、防疫卫士、抑菌湿帘、消毒除臭剂等畜牧业用防疫、环保产品的开发，2020-10至2022-10，15万元；

8.        横向课题：广西壮族自治区中医药研究院--壮瑶药挥发油抗病毒筛选及效果鉴定，负责抗流感病毒药物的筛选及效果评价，2020-01至2021-12，15万元；

9.        横向课题：创澳（上海）环保科技发展有限公司-- APEX澳飘克斯®植物精油除臭剂对蚊蝇的驱避效果，2020-01至2021-12，5万元；

10.    科学技术部，国家重点基础研究发展计划（973计划）课题，2014CB542703-2，PRRSV与PCV2等病原共感染在调控炎症反应及致病性中的作用，2014-01至2018-12，86.4万元；（已结题）

11.    中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目，2019JB10，JEV感染猪/小鼠引发睾丸炎的分子机制，2019-01至2021-12，12万；（已结题）

12.    中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目，2017JB10，基因Ⅰ型与基因Ⅲ型JEV毒株间交叉保护作用研究，2017-01至2018-12，15万元；（已结题）

（二）作为项目骨干参与项目（4项）：

1.        科学技术部，国家重点研发计划项目政府间国际科技创新合作重点专项，2018YFE0101300，新型高效安全的猪链球菌BoHV-4 活载体疫苗研究，2019-01至2021-12，495万元，在研，项目骨干，负责BoHV-4 活载体疫苗在猪体上免疫原性评价；

2.        上海市科学技术委员会，农业重点科技攻关项目，17391901600，乙型脑炎病毒基因I型弱毒苗研究，2017-12至2021-12，80万元，在研，项目骨干，负责乙型脑炎病毒基因I型弱毒苗研制与新兽药证书申报；

3.        中国农业科学院基本科研业务费专项院级统筹项目，Y2019YJ07-02，非洲猪瘟联合攻关-诊断与检测技术与产品研发，2019-11至2020-12，100万元，项目骨干，负责非洲猪瘟现场快速检测试剂及其便携式恒温基因扩增仪的研制；

4.        科学技术部，国家国际科技合作专项，2014DEF30140，乙脑病毒优势型别变化的生态流行病学及风险，2014-11至2017-12，127万元，已结题，项目骨干，负责乙脑病毒生态流行病学调查与风险评估。

一、发表论文

以第一作者或通讯作者在PLoS Pathog、Transbound Emerg Dis、Front Microbiol、Antiviral Research等杂志上发表SCI论文17篇（其中JCR一区1篇，JCR二区13篇）

1.       Chenxi Li, Di Di, Hui Huang, Xin Wang, Qiqi Xia, XiaochunMa, Ke Liu, Beibei Li,Donghua Shao, Yafeng Qiu, Zongjie Li, JianchaoWei*, Zhiyong Ma*. NS5-V372A and NS5-H386Y variations are responsiblefor differences in interferon α/β induction and co-contribute to thereplication advantage of Japanese encephalitis virus genotype I over genotypeIII in ducklings[J].PLoS Pathog,2020,16(9): e1008773.（JCR一区，IF=6.218）

2.       Jianchao Wei#, Muddassar Hameed#, Xin Wang#, JunjieZhang, Shuang Guo, Muhammad Naveed Anwar, Linlin Pang, Ke Liu, Beibei Li,Donghua Shao , Yafeng Qiu , Dengke Zhong*, Bin Zhou*, Zhiyong Ma*.Antiviralactivity of phage display-selected peptides against Japanese encephalitis virusinfection in vitro and in vivo[J].Antiviral Research,2020,174:104673. （JCR二区，IF=4.13）

3.       Jianchao Wei, Xin Wang, Junjie Zhang, Shuang Guo,Linlin Pang, Kun Shi, Ke Liu,Donghua Shao, Yafeng Qiu, Lihong Liu, FrederikWide′n, Beibei Li*, Zhiyong Ma*.Partial cross-protection between Japaneseencephalitis virus genotype I and III in mice[J].PLoS Negl TropDis,2019,13(8):e0007601. （JCR二区，IF=4.487）

4.       Muddassar Hameed,Ke Liu,Muhammad Naveed Anwar,AbdulWahaab,Chenxi Li, Di Di,Xin Wang,Sawar Khan,Jinpeng Xu,Beibei Li,MohsinNawaz,Donghua Shao,Yafeng Qiu,Jianchao Wei*,Zhiyong Ma*.A viralmetagenomic analysis reveals rich viral abundance and diversity in mosquitoesfrom pig farms[J]. Transbound Emerg Dis,2020,00:1-16. doi:10.1111/tbed.13355. （JCR二区，IF=4.188）

5.       Muddassar Hameed,Sawar Khan,Jinpeng Xu,Junjie Zhang,XinWang,Di Di,Zheng Chen,Muhammad Naveed Anwar,Abdul Wahaab,Xiaochun Ma,MohsinNawaz,Ke Liu,Beibei Li,Donghua Shao,Yafeng Qiu,Jianchao Wei*,ZhiyongMa*.Detection of Japanese Encephalitis Virus in Mosquitoes from Xinjiang duringNext Generation Sequencing Arboviral Surveillance[J]. Transbound Emerg Dis. 2020Jul 2. doi: 10.1111/tbed.13697. （JCR二区，IF=4.188）

6.       Muddassar Hameed, Ke Liu, Muhammad Naveed Anwar, AbdulWahaab,Anum Safdar, Di Di, Prerona Boruah, Jinpeng Xu, Xin Wang, Beibei Li,Huaimin Zhu,Mohsin Nawaz, Donghua Shao, Yafeng Qiu, Jianchao Wei*,Zhiyong Ma*.The emerged genotype I of Japanese encephalitis virus shows aninfectivity similar to genotype III in Culex pipiens mosquitoes from China.PLoS Negl Trop Dis,2019, 13(9):e0007716. （JCR二区，IF=4.487）

7.       Changguang Xiao, Xin Wang, Guanghui Cui, Linlin Pang,Jinpeng Xu, Chenxi Li,  Junjie Zhang, Ke Liu, Beibei Li, Donghua Shao,Yafeng Qiu, Wei Jianchao*, Ma Zhiyong*,Possible pathogenicity ofJapanese encephalitis virus in newly hatched domestic ducklings[J].VetMicrobiol. 2018,227:8-11. doi: 10.1016/j.vetmic.2018.10.016. （JCR二区，IF=2.791）

8.       Changguang Xiao, Chenxi Li, Di Di, Julien Cappelle,Lihong Liu, Xin Wang, Linlin Pang, Jinpeng Xu, Ke Liu, Beibei Li, Donghua Shao,Yafeng Qiu, Weijie Ren, Frederik Wide´n, Ve´ronique Chevalier, JianchaoWei*, Xiaodong Wu*, Zhiyong Ma*,Differential replication efficienciesbetween Japanese encephalitis virus genotype I and III in avian cultured cellsand young domestic ducklings[J].PLoS Negl Trop Dis. 2018,12(12):e0007046. （JCR二区，IF=4.487）

9.       Muddassar Hameed†, Abdul Wahaab†, Tongling Shan†, XinWang, Sawar Khan, Di Di,Liu Xiqian, Jun-Jie Zhang, Muhammad Naveed Anwar,Mohsin Nawaz, Beibei Li, Ke Liu,Donghua Shao, Yafeng Qiu, Jianchao Wei* andZhiyong Ma*. A Metagenomic Analysis of Mosquito Virome Collected FromDifferent Animal Farms at Yunnan-Myanmar Border of China[J]. .Front Microbiol. 2021 Feb8;11:591478. （JCR二区，IF=4.235）

10.   Muhammad Naveed Anwar, Xin Wang, Muddassar Hameed, AbdulWahaab, Chenxi Li ,Mona Sharma, Linlin Pang, Muhammad Irfan Malik, Ke Liu,Beibei Li, Yafeng Qiu,Jianchao Wei*, Zhiyong Ma*.Phenotypic andGenotypic Comparison of a Live-Attenuated Genotype I Japanese EncephalitisVirus SD12-F120 Strain with Its Virulent Parental SD12 Strain[J].Viruses 2020,12, 552; doi:10.3390/v12050552. （JCR二区，IF=3.811）

11.   Di Di, Chenxi Li, Junjie Zhang, Muddassar Hameed , XinWang, Qiqi Xia, Hui Li, Shumin Xi,Zongjie Li, Ke Liu, Beibei Li, Donghua Shao,Yafeng Qiu, Jianchao Wei*,Zhiyong Ma*. Experimental Infection ofNewly Hatched Domestic Ducklings via Japanese Encephalitis Virus-InfectedMosquitoes[J].Pathogens, 2020, 9, 371; doi:10.3390/pathogens9050371. （JCR三区，IF=3.405）

12.   Xin Wang, Shuang Guo, Muddassar Hameed, Junjie Zhang,Linlin Pang, Beibei Li,Yafeng Qiu, Ke Liu, Donghua Shao, Zhiyong Ma, DengkeZhong*, Jianchao Wei*,Peng Li*. Rapid differential detection of genotype Iand III Japanese encephalitis virus from clinical samples by a novel duplexTaqMan probe-based RT-qPCR assay[J].Journal of VirologicalMethods, 2020,279,113841（JCR四区，IF=1.746）

13.   Zongjie Li#, Jianchao Wei#, Di Di, Xin Wang, ChenxiLi, Beibei Li,Yafeng Qiu, Ke Liu, Feng Gu, Minglong Tong, ShuimingWang,Xiaodong Wu*,Zhiyong Ma*,Rapid and accurate detection of African swine fevervirus by DNA endonuclease-targeted CRISPR trans reporter assay.Acta BiochimBiophys Sin (Shanghai). 2020 Dec 29;52(12):1413-1419.  （JCR二区，IF=2.836）

14.   Muhammad Naveed Anwar, Shuang Guo, Wang Xin, MuddassarHameed, Abdul Wahaab, Xiaochun Ma, Aman Ullah Khan, Sajid Ur Rahman, DonghuaShao, Zongjie Li, Ke Liu, Beibei Li, Yafeng Qiu, Zhiyong Ma*, JianchaoWei*.Adaptation of a live-attenuated genotype I Japanese encephalitis virus tovero cells is associated with mutations in structural protein genes.Virus Res.2021 Jan 15;292:198256. （JCR三区，IF=2.934）

15.   Muddassar Hameed*, Abdul Wahaab, Mohsin Nawaz, SawarKhan, Jawad Nazir, Ke Liu, Jianchao Wei*,Zhiyong Ma *.Potential Role ofBirds in Japanese Encephalitis Virus Zoonotic Transmission and GenotypeShift.Viruses. 2021 Feb 24;13(3):357. （JCR二区，IF=3.811）

16.   Di Di, Li Chen-xi, Li Zong-jie, Wang Xin, Xia Qi-qi, MonaSHARMA, Li Bei-bei, Liu Ke, Shao Dong-hua, Qiu Ya-feng, Soe-Soe WAI, YangShi-biao, Wei Jian-chao*, Ma Zhi-yong*. Detection ofarboviruses in Culicoides (Diptera: Ceratopogonidae) collected from animalfarms in the border areas of Yunnan Province,Chin.Journal of IntegrativeAgriculture,2021, 20(0): 2–12. （JCR二区，IF=2.848）.

17.   Anwar MN, Jiang C, Di D, Zhang J, Guo S, Wang X, HameedM, Wahaab A, Shao D, Li Z, Liu K, Li B, Qiu Y, Ma Z*, Wei J*.A Novel Recombinant Virus-LikeParticles Displaying B and T Cell Epitopes of Japanese Encephalitis VirusOffers Protective Immunity in Mice and Guinea Pigs.Vaccines (Basel).2021 Sep 2;9(9):980. （JCR二区，IF=4.422）

二、授权专利（7项）

获得授权的国家发明专利7项，排名第一1项，排名第二3项，排名第三3项

1.       魏建超，马志永，史子学，邵东华，李蓓蓓，晏文君，朱紫祥，抑制流感病毒相关基因的siRNA及其应用，2018.8.31，中国，ZL201610139670.0（排名第一）

2.       马志永，魏建超，史子学，邵东华，李蓓蓓，晏文君，朱紫祥，一种重组载体及其在制备或筛选抗流感药物中的应用，2019.4.2，中国，ZL201610139667.9（排名第二）

3.       马志永，魏建超，史子学，邵东华，李蓓蓓，晏文君，朱紫祥，一种重组载体及其在制备或筛选抗流感药物中的应用，2019.4.2，中国，ZL201610141142.9 （排名第二）

4.       马志永，魏建超，史子学，薛飞群，李蓓蓓，一类抗乙型脑炎病毒感染的组合物及其应用，2018.10.23，中国，ZL201510391532.7 （排名第三）

5.       马志永，史子学，魏建超，邵东华，王少辉，李蓓蓓，刘阳，一步法检测Z/S亚型埃博拉病毒的实时荧光定量PCR方法及其试剂盒，2017.3.22，中国，ZL201110312855.4（排名第三）

6.       马志永，史子学，魏建超，邵东华，王少辉，李蓓蓓，晏文君，朱紫祥，抑制流感病毒相关基因的siRNA及其应用，2018.2.13，中国，ZL201210019712.9 （排名第三）

7.       马志永，史子学，魏建超，邵东华，王少辉，李蓓蓓，晏文君，朱紫祥，抑制流感病毒复制的宿主相关基因及其筛选方法和应用，2018.4.6，中国，ZL201210019736.4 （排名第三）