牛羊传染病研究创新团队是国内专门从事牛羊传染病研究的知名团队。团队由首席科学家(研究员1人)、科研骨干(研究员1人、副研究员2人)、研究助理(助理研究员2人、博士后3人）、科研助理(4人)及在读博士研究生(4人)、硕士研究生(15人)组成。围绕牛羊重要传染病及人畜共患病开展基础及应用研究。

主要研究方向为：

（1）牛羊重大疾病疫苗创制与诊断试剂的研发，聚焦于牛羊传染病新型诊断制剂的研发，创制分子标记、多联防控疫苗，构建牛羊重要传染病的高效实用防控技术体系，以服务于全国牛羊传染病的防治。

（2）牛羊病原微生物的流行、感染及致病机制，调查相关病原微生物的流行及进化规律，探索牛病毒性腹泻病毒、轮状病毒、冠状病毒、戊型肝炎病毒以及牛副流感病毒等病原编码基因的功能以及致病的分子机制，解析相关的免疫保护和逃逸机制。

（3）动物病原微生物感染与宿主细胞互作，以戊型肝炎病毒、轮状病毒以及牛病毒性腹泻病毒等几种重要的牛源及人畜共患病原体为研究对象，通过高通量多组学、分子病毒学、分子免疫学等技术探索病毒与宿主的互作，阐释病毒的复制及感染规律。

1.     中国农业科学院“青年英才”引进工程配套项目-自主命题：202010-202509，主持人，经费300万

2.     兽医生物技术国家重点实验室自主研究项目：牛病毒性腹泻病毒复制必需因子的鉴定及功能解析：202010-202209，主持人，经费100万

3.     国家自然科学基金面上项目：准囊膜戊型肝炎病毒粒子形成机制的研究：202201-202512，主持人，经费58万

4.     黑龙江省杰出青年基金项目：牛功能基因高通量筛选平台的建立及应用：202109-202408，主持人，经费50万

1.      Martin-Sancho L, Lewinski MK, Pache L, Stoneham CA, Yin X, Becker ME, Pratt D, Churas C, Rosenthal SB, Liu S, Weston S, De Jesus PD, O'Neill AM, Gounder AP, Nguyen C, Pu Y, Curry HM, Oom AL, Miorin L, Rodriguez-Frandsen A, Zheng F, Wu C, Xiong Y, Urbanowski M, Shaw ML, Chang MW, Benner C, Hope TJ, Frieman MB, García-Sastre A, Ideker T, Hultquist JF, Guatelli J, Chanda SK*, Functional landscape of SARS-CoV-2 cellular restriction, Mol Cell. 2021 Jun 17;81(12):2656-2668.e8. doi: 10.1016/j.molcel.2021.04.008. Epub 2021 Apr 13.

2.      Bremer W, Blasczyk H, Yin X, Salinas E, Grakoui A, Feng Z, Walker C*, Resolution of hepatitis E virus infection in CD8+ T cell-depleted rhesus macaques, J Hepatol. 2021 Sep;75(3):557-564. doi: 10.1016/j.jhep.2021.04.036. 

3.      Lu G, Pan J, Zhang Y, Sun X, Ou J, Ji J, Yin X*, Li S*, Hepatitis B virus detected in a golden monkey fatal case, China, Infect Genet Evol. 2021 Oct; 94:105032. doi: 10.1016/j.meegid.2021.105032. （共同通讯作者）

4.      Sari G, Zhu J, Ambardekar C, Yin X, Boonstra A, Feng Z*, Vanwolleghem T*, The viral ORF3 protein is required for hepatitis E virus apical release and efficient growth in polarized hepatocytes and humanized mice. J Virol. 2021 Sep 15: JVI0058521. doi: 10.1128/JVI.00585-21. 

5.      Liu X.; Wang M.; Yin X*, Cellular Organelles Involved in Hepatitis E Virus Infection. Pathogens 2021, 10, 1206. https://doi.org/10.3390/pathogens10091206.

6.      Yuan S#, Yin X#, Meng X#, Chan J#, Ye Z#, Riva L, Pache L, Chan C, Lai P, Chan C, Poon V, Lee A, Matsunaga N, Pu Y, Yuen C, Cao J, Liang R, Tang K, Sheng L, Du Y, Xu W, Lau C, Sit K, Au W, Wang R, Zhang Y, Tang Y, Clausen T, Pihl J, Oh J, Sze K, Zhang A, Chu H, Kok K, Wang D, Cai X, Esko J, Hung I, Li R, Chen H, Sun H, Jin D, Sun R*, Chanda S*, Yuen K*, Clofazimine broadly inhibits coronaviruses including SARS-CoV-2, Nature, 2021 Mar 16. doi: 10.1038/s41586-021-03431-4. （共同第一作者）

7.      Yin X, Riva L, Pu Y, Martin-Sancho L, Kanamune J, Yamamoto Y, Sakai K, Gotoh S, Miorin L, Jesus P, Yang C, Herbert K, Yoh S, Hultquist J, García-Sastre A, Chanda S*, MDA5 Governs the Innate Immune Response to SARS-CoV-2 in Lung Epithelial Cells, Cell Reports, 2021, 34(2): 108628.  

8.      Ren H#, Yin X#, Su C, Guo M, Wang X, Na L, Lin Z, Wang X*, Equine lentivirus counteracts SAMHD1 restriction by Rev-mediated degradation of SAMHD1 via the BECN1-dependent lysosomal pathway, Autophagy 2020, DOI: 10.1080/15548627.2020.1846301. （共同第一作者）

9.      Riva L#, Yuan S#, Yin X, Martin L, Matsunaga N, Pache L, Burgstaller S, Jesus P, Teriete P, Hull, M, Chang M, Chan J, Cao J, Poon V, Herbert K, Cheng K, Nguyen T, Rubanov A, Pu Y, Nguyen C, Choi A, Rathnasinghe R, Schotsaert M, Miorin L, Dejosez M, Zwaka T, Sit K, Martinez L, Liu W, White K, Chapman M, Lendy E, Glynne R, Albrecht R, Ruppin E, Mesecar A, Johnson J, Benner C, Sun R, Schultz P, Su A, García-Sastre A, Chatterjee A*, Yuen K*, Chanda S*, Discovery of SARS-CoV-2 antiviral drugs through large-scale compound repurposing. Nature 2020, Oct,586(7827):113-119. doi: 10.1038/s41586-020-2577-1. Epub 2020 Jul 24.

10.    Clausen T#, Sandoval D#, Spliid C, Pihl J, Perrett H, Painter C, Narayanan A, Majowicz S, Kwong E, McVicar R, Thacker B, Glass C, Yang Z, Torres J, Golden G, Bartels P, Porell R, Garretson A, Laubach L, Feldman J, Yin X, Pu Y, Hauser B, Caradonna T, Kellman B, Martino C, Gordts P, Chanda S, Schmidt A, Godula K, Leibel S, Jose J, Corbett K, Ward A, Carlin A, Esko J*，SARS-CoV-2 Infection Depends on Cellular Heparan Sulfate and ACE2. Cell 2020, Sep 14,S0092-8674(20)31230-7.

11.    Langer S#, Yin X#, Arturo D#, Portillo A, Gordon D, Rogers U, Marlett J, Young J, Pache L*, Chanda S*. The E3 ubiquitin-protein ligase Cullin 3 regulates HIV-1 transcription. Cells 2020, 9(9), 2010 （共同第一作者）

12.    Yin X#, Langer S#, Zhang Z#, Herbert M, König R, Yoh S, Chanda S*. Sensor Sensibility - HIV-1 and the innate immune response. Cells 2019 (Invited review). 2020, 20,9(1):254 （共同第一作者）

13.    Yin X*, Feng Z*. Hepatitis E Virus Entry. Viruses 2019, 11(10):883.（共同通讯作者）

14.    Liu C#, Cai W#, Yin X#, Tang Z, Wen G, Ambardekar C, Li X, Ying D, Feng Z*, Zheng Z*, Xia N. An optimized high-throughput neutralization assay for Hepatitis E Virus (HEV) involving detection of secreted porf2. Viruses 2019, 11, (1)（共同第一作者）

15.    Yin X, Ying D, Lhomme S, Tang Z, Walker C, Xia N, Zheng Z*, Feng Z*, Origin, antigenicity, and function of a secreted form of ORF2 in hepatitis E virus infection. Proc Natl Acad Sci U S A 2018, 115(18):4773-4778. 

16.    Yin X, Li X, Ambardekar C, Hu Z, Lhomme S, Feng Z*, Hepatitis E virus persists in the presence of a type III interferon response. PloS Pathogens 2017, 13, (5), e1006417.

17.    Yin X, Ambardekar C, Lu Y, and Feng Z*. Distinct entry mechanisms for non-enveloped and quasi-enveloped hepatitis E viruses. J Virol. 2016, 90(8):4232-4242.

18.    Yin X, Li X, Feng Z*. Role of envelopment in the HEV life cycle. Viruses 2016, 8, (8).

19.    Yin X#, Hu Z#, Gu Q, Wu X, Zheng YH, Wei P, Wang X*. Equine tetherin blocks retrovirus release and its activity is antagonized by equine infectious anemia virus envelope protein. J Virol. 2014, 88(2):1259-1270.（共同第一作者）

本团队与比利时列日大学（University of Liège）、美国俄亥俄州立大学（Ohio State University）、美国全国儿童医院（Nationwide Children's Hospital）斯克利普斯研究所（Scripps Research）、亚利桑那州立大学（Arizona State University）等高校及研究所开展相关课题合作研究，可联合培养博士研究生，推荐优秀学生到相关实验室交流访问从事相关合作课题研究。