棉花生理生态创新团队成立组建于2014年，是第2批进入中国农业科学院创新工程的创新团队。团队现有固定人员14人，其中首席1人，科研骨干6人，科研助理7人。

重点任务：面向新疆棉区缺水、低温、肥料利用率低等生产问题，以及棉花非生物胁迫生物学机制方面的科学问题，筛选抗旱节水、营养高效、耐低温等高产优质高效品种，研究其性状差异的遗传学和生物学机制，开发高产、营养高效、抗逆的肥料产品，研发节水、节肥、抗逆栽培新技术。从理论、品种、产品、技术四方面开展创新性研究，建设上中下游紧密结合的问题导向、市场导向的“三创” 团队，从而显著提高新疆棉区水肥利用效率和抵抗逆境危害的能力，为我国棉花产量稳步提升和棉花产业可持续发展提供科技支撑。

研究目标：筛选出一批抗旱节水、营养高效、耐低温等高产优质高效棉花品种，逐步明确棉花抗旱、营养高效、耐低温的生物学机制，研发水肥高效、抗逆新技术以及叶面肥和水溶性系列肥料产品，在新疆棉区开展集成示范推广，大幅度提高棉田水肥利用效率和棉花抗逆能力。

研究方向：（1）棉花抗旱机制及节水技术研发；（2）棉花养分高效利用机制及高效施肥技术研究；（3）棉花低温响应生物学和抗低温技术研发。

(1)、国家自然科学基金面上项目，32072113，GhDREB1与GhNAC029协同调控棉花低温响应的机制研究，2021/01-2014/12，58万元，主持；

(2)、中国农业科学院科技创新工程，棉花生理生态创新团队，2021/01-2015/12，500万元，主持；

(3)、“万人计划”青年拔尖人才，2015/12-至今，农业科学， 170万元，主持；

(4)、国家自然科学基金青年科学基金项目，31301366，一氧化氮在棉花叶片衰老过程中的作用机制研究，2014/01-2016/12，25万元，主持；

(5)、国家科技支撑计划，2014BAD03B01，抗旱、耐盐碱棉花品种筛选及新品种培育，2014/01-2016/12，639万元，主持；

(6)、国家973 计划，2010CB126006，优质高产棉花品种的分子改良，2010/01-2014/08，763 万元，研究骨干。

(1)  Zhang, X., Chen, J., Feng, K.,Wang,N., Zhang, S., Ma, H., Ge, C., Shen, Q., Liu, R., Zhao, X., Liu, S.,Du,X., & Pang, C. (2021). Widely targeted metabolomics reveals the differentmetabolic changes in leaves and roots of two cotton varieties under drought stress. J Agro Crop Sci.,00 19.https://doi.org/10.1111/jac.12527.

(2)  Qian Shen#; Siping Zhang#; ShaodongLiu; Jing Chen; Huijuan Ma; Ziqian Cui; Xiaomeng Zhang; Changwei Ge; Ruihua Liu;Yang Li; Xinhua Zhao; Guozheng Yang*; Meizhen Song*; Chaoyou Pang*; Comparative transcriptome analysis provides insightsinto the seed germination in cotton in response to chilling stress, InternationalJournal of Molecular Sciences, 2020, 21: 2067.

(3)  Ge Changwei*; Yang Yongfei; Wang Li;Li Shicong; Zhou Yuqing; Zhang Siping; Liu Shaodong; Chen Jing; Shen Qian; LiuRuihua; Ma Huijuan; Li Yang; Zhao Xinhua; PangChaoyou*; GhRH32 negatively regulates cold tolerance in upland cotton(Gossypium hirsutum L.), Plant Growth Regulation, 91(2) :201-208.

(4)  Feiyan Ju#, Shaodong Liu#,Siping Zhang, Huijuan Ma, Jing Chen, Changwei Ge, Qian Shen, Xiaomeng Zhang,Xinhua Zhao*, Yongjiang Zhang* and Chaoyou Pang*, Transcriptome analysis andidentification of genes associated with fruiting branch internode elongation inupland cotton, BMC Plant Biology, 2019, 19:415.

(5)  Hai Ming Li#, Shao DongLiu#, Chang Wei Ge, Xiao Meng Zhang, Si Ping Zhang,Jing Chen, QianShen, Fei Yan Ju, Yong Fei Yang, Yang Li, Rui Hua Liu 1,Hui Juan Ma, Xin-HuaZhao, Cun Dong Li *, and Chaoyou Pang*, Association Analysis of  Drought Tolerance and Associated Traits inUpland Cotton at the Seedling Stage, International Journal of Molecular Sciences,2019, 20, 3888.

(6)   Jing Niu#, Siping Zhang#, Shaodong Liu,Huijuan Ma, Jing Chen, Qian Shen, Changwei Ge,Xiaomeng Zhang, Chaoyou Pang*, Xinhua Zhao*. The compensation effects of physiology and yield incotton after drought stress，Journal of Plant Physiology，2018，224: 30-48.

(7)  Guanghui Xiao*#,Peng He#, Peng Zhao, Hao Liu, Li Zhang, Chaoyou Pang*, Jianing Yu* Genome-wide identification of the GhARFgene family reveals that.  GhARF2 andGhARF18 are involved in cotton fibre cell initiation，Journal ofExperimental Botany, 2018,69(18):4323-4337.

(8)  Xuewei Zheng, Shuli Fan, HenglingWei, Chengcheng Tao, Qiang Ma, Qifeng Ma，Siping Zhang , Hongbin Li*, Chaoyou Pang* , and Shuxun Yu. iTRAQ-based quantitative proteomic analysis reveals cold responsiveproteins Involved in leaf senescence in upland cotton (Gossypium hirsutum L.). Int. J.Mol. Sci. 2017, 18:1984.

(9)  Lingling Dou, Xiaoyun Jia, HenglingWei, Shuli Fan, Hantao Wang, Yaning Guo,Shan Duan, Chaoyou Pang*, Shuxun Yu*. Global analysis of DNA methylation inyoung (J1) and senescent (J2) Gossypium hirsutum L. cotyledons by MeDIP-Seq.PLoS One. 2017, 12(7):e0179141.

(10)     Junji Su, ShuliFan, LibeiLi, HenglingWei , CaixiangWang, HantaoWang,Meizhen Song, ChiZhang, LijiaoGu, ShuqiZhao, GuangzhiMao, ChengsheWang, Chaoyou Pang*, ShuxunYu*. Detection offavorable QTL alleles and candidate genes for lint percentage by GWAS inChinese upland cotton. Front. Plant Sci, 2016, 7: 1576.

(11)     Fengli Zhao, Jianhui Ma , Libei Li, Shuli Fan, Yaning Guo, Meizhen Song,Hengling Wei, Chaoyou Pang* , ShuxunYu* . GhNAC12, a neutral candidategene, leads to early aging in cotton(Gossypium hirsutum L). Gene, 2016, 576:268-274.

(12)     Meng Yanyan#, Liu Feng#, Pang Chaoyou, Fan Shuli, Song Meizhen, Wang Dan,Li Weihua*, Yu Shuxun*. Label-free quantitative proteomics analysis of cotton leafresponse to nitric oxide. Journal of ProteomeResearch, 2011, 10(12): 5416-5432.2011, 6(12): e28676.

(13)     Pang Chaoyou#, Wang Hui#, Pang Yu, Xu Chao, Jiao Yue, Qin Yongmei,Western TL, Yu Shuxun*, Zhu Yuxian*.Comparative proteomics indicatesthat biosynthesis of pectic precursors is important for cotton fiber and Arabidopsis root hair elongation, Molecular & Cellular Proteomics,2010, 9: 2019-2033. 

(14)     庞朝友，秦咏梅，喻树迅. 棉花纤维特异转录因子GhMADS9的克隆及功能初步分析. 棉花学报, 2010, 22(6): 515-520. 

(15)     Pang Chaoyou, Du Xiongming, Ma Zhiying. Evaluation of the introgressed lines and screening for elite germplasm in Gossypium. Chinese Science Bulletin, 2006, 51(1): 1-9. 

(16)     庞朝友，杜雄明，马峙英. 棉属种间杂交基因渐渗系SSR标记及其表型性状的聚类分析. 作物学报，2006，32(9)：1371-1378. 

(17)      庞朝友，杜雄明，马峙英. 具有野生棉外源基因的陆地棉特异种质创造与利用进展. 棉花学报，2005，17(3)：171-177.

(18)      《中国短季棉改良创新三十年》，2013，中国农业科学技术出版社，副主编；

(19)      《棉花纤维发育生物学》，2016，科学出版社；作为主编助理统稿全书，并作为第六章的主要撰稿人之一；

(20)      《快乐植棉》，2016，中国农业科学技术出版社，参编；

(21)      《中国棉麻丝产业可持续发展研究》，2015，中国农业科学技术出版社，参编；

(22)      棉花新品种中915（中棉所94A915），山西省审定，第3完成人；

(23)      特早熟棉花新品种中213（中棉所94A213），河南省审定，第4完成人；

(24)      夏播棉花新品种中夏杂06（中棉所85），河南省审定，第4完成人

(25)     特早熟棉花新品种中361（中棉所94A361），河南省审定，第5完成人。

专利情况

1.  朱玉贤，庞朝友，逄宇，王慧，靳翔，秦咏梅. 尿苷二磷酸葡萄糖醛酸异构酶及其编码基因与应用. 专利号：ZL 200910204297.2；

2.  朱玉贤，庞朝友，逄宇， 宋文强，王慧，靳翔，秦咏梅. 尿苷二磷酸木糖异构酶及其编码基因与应用. 专利号：ZL200910204298.7；

3.  朱玉贤，庞朝友，逄宇，王慧，靳翔，秦咏梅. 尿苷二磷酸-4-酮-6-脱氧葡萄糖异构还原酶及其编码基因与应用.专利号：ZL200810246725. 

4.   李淑叶，赵新华，庞朝友，张思平，刘绍东，沈倩，葛常伟，陈静，马慧娟，张小萌. 一种棉花低温调节剂及其制备方法和使用方法. 专利号：ZL 201711385588.7；

5.   庞朝友，沈倩，赵新华，马慧娟，张思平，刘绍东，陈静，葛常伟，张小萌，一种棉花抗低温种衣剂及其制备方法，专利申请号：201810936647.3；

6.   庞朝友，巨飞燕，赵新华，张思平，刘绍东，马慧娟，陈静，葛常伟，刘卫星，沈倩，刘瑞华，张小萌，一种调节棉花株型结构的方法，专利申请号：201811258521.1.